Le siège du conseil régional est situé à Charbonnières-les-Bains, en bordure de l’ex-N7, depuis sa création, en 1974. Situé au nord-ouest de l’agglomération lyonnaise, il est réputé mal desservi par les transports en commun, puisque seule la ligne de bus 86 des TCL est directe.
Le déménagement du siège est prévu à Lyon, dans le nouveau quartier du Confluent. Originellement prévu pour l’automne 2009, le nouveau bâtiment, conçu par l’architecte Christian de Portzamparc, devrait être mis en service en septembre 2010.
Le programme voté lors de l’assemblée plénière du 7 avril 2005 porte sur la construction de 38 000 m2 de bureaux, pour un effectif évalué à 1 400 agents. Le bâtiment répond aux normes HQE (Haute qualité environnementale). L’emplacement a été choisi à la fois pour que la région ait son siège dans la ville chef-lieu et pour être facilement accessible en transports en commun depuis les autres départements de la Région.
Les présidents depuis 1974 :
- Paul Ribeyre (1974-1980)
- Michel Durafour (1980-1981)
- Charles Béraudier (1981-1988)
- Charles Millon (1988-1999)
- Anne-Marie Comparini (1999-2004)
- Jean-Jack Queyranne (2004-2010)